安政2年（1855年）6月

水口藩校翼輪堂創立

明治4年（1871年）11月

尚志館と改称

明治5年（1872年）

尚志館廃校

明治41年（1908年）4月1日

滋賀県立水口農林学校創立

大正8年（1919年）4月1日

滋賀県立水口中学校設立（農林学校と併設）

大正10年（1921年）3月31日

滋賀県立水口農林学校廃校

昭和23年（1948年）4月1日

滋賀県立甲賀高等学校開校
（学制改革により滋賀県立水口中学校、同水口高等女学校、同甲南女子農学校を統合）

昭和27年（1952年）4月1日

滋賀県立甲賀高等学校甲南校舎分離
（県立甲南高等学校となる）

昭和33年（1958年）12月13日

創立50周年記念式典挙行

昭和43年（1968年）11月23日

創立60周年記念式典挙行

昭和50年（1975年）4月1日

滋賀県立水口高等学校と校名変更

昭和53年（1978年）11月22日

創立70周年記念式典挙行

昭和63年（1988年）11月25日

創立80周年記念式典挙行

平成6年（1994年）4月1日

普通科国際コース・体育コース新設

平成9年（1997年）4月1日

国際学科国際文化科新設

平成10年（1998年）11月25日

創立90周年記念式典挙行

平成18年（2006年）11月8日

国際学科国際文化科創設10周年記念式典挙行

平成20年（2008年）11月22日

創立百周年記念式典挙行

平成25年（2013年）4月1日

普通科国際文化コース新設
（これにより国際学科国際文化科は募集停止）

平成26年（2014年）4月1日

普通科理数強化クラス新設

平成29年（2017年）4月1日

普通科特進クラスを文系・理系に改編

平成30年（2018年）11月10日

創立110周年記念式典挙行